🧬 Simulación Interactiva: Expresión Génica — Transcripción y Traducción

Bienvenido a la Expresión Génica

Explora de forma interactiva cómo la información del ADN se convierte en proteínas funcionales. Navega por las secciones para entender cada proceso paso a paso.

📝 Transcripción

El ADN se copia en ARN mensajero (ARNm) en el núcleo celular. Incluye iniciación, elongación y terminación, tanto en procariotas como en eucariotas.

🔄 Maduración del ARNm

En eucariotas, el ARN transcrito primario (pre-ARNm) sufre modificaciones: cap 5', cola poli-A y splicing (eliminación de intrones).

⚙️ Traducción

El ARNm maduro se traduce en una cadena polipeptídica en el citoplasma, mediante ribosomas (ARNr) y ARN de transferencia (ARNt).

Flujo general: ADN → ARNm (núcleo) → ARNm maduro → Proteína (citoplasma)

📌 Dogma Central de la Biología Molecular

La información genética fluye en la siguiente dirección:

🦠 Procariotas vs 🧫 Eucariotas

CaracterísticaProcariotasEucariotas
UbicaciónCitoplasmaNúcleo
ARN polimerasaUna tipoTres tipos (I, II, III)
MaduraciónNoSí (cap, poli-A, splicing)
Transcripción y traducciónSimultáneasSeparadas en espacio y tiempo
ARNmPolicistrónicoMonocistrónico

🔑 Componentes Clave

  • ADN: Molécula de doble hélice con la información genética
  • ARN polimerasa: Enzima que sintetiza ARN a partir de ADN
  • ARNm: Mensajero que lleva la información al citoplasma
  • ARNr: Componente estructural del ribosoma
  • ARNt: Transporta aminoácidos al ribosoma
  • Ribosoma: Máquina molecular que sintetiza proteínas

Transcripción del ADN

La transcripción es el proceso mediante el cual la información de un gen en el ADN se copia en una molécula de ARN mensajero. Observa las tres fases: iniciación, elongación y terminación.

1️⃣ Iniciación
2️⃣ Elongación
3️⃣ Terminación
🏃 Velocidad:
Estado: Listo para iniciar — Selecciona el tipo de célula y presiona "Iniciar"
ADN (cadena molde)
ADN (cadena codificante)
ARN mensajero
ARN Polimerasa
Promotor / Terminador

1️⃣ Iniciación

La ARN polimerasa se une al promotor del ADN. En eucariotas, factores de transcripción ayudan al reconocimiento. La doble hélice se abre localmente formando la "burbuja de transcripción".

2️⃣ Elongación

La ARN polimerasa avanza leyendo la cadena molde (3'→5') y sintetiza ARN complementario (5'→3'). Se incorporan nucleótidos de ARN (A, U, C, G) apareándose con el ADN molde.

3️⃣ Terminación

La ARN polimerasa llega a la señal de terminación. En procariotas, la horquilla rho-independiente o el factor rho detienen la transcripción. En eucariotas, se corta el ARN y la polimerasa se libera.

📊 Datos clave

  • Velocidad: ~40 nucleótidos/seg (eucariotas)
  • Velocidad: ~50-90 nucleótidos/seg (procariotas)
  • Uracilo (U) reemplaza a Timina (T)
  • Solo se transcribe una cadena (molde)

Maduración del ARN Mensajero

En eucariotas, el ARN transcrito primario (pre-ARNm) debe procesarse antes de salir del núcleo. Este proceso incluye tres modificaciones principales.

Estado: pre-ARNm sin procesar — Contiene intrones y exones
1️⃣ Cap 5'
2️⃣ Cola Poli-A
3️⃣ Splicing
4️⃣ Exportación
Exones (codificantes)
Intrones (no codificantes)
Cap 5'
Cola Poli-A (3')

🎩 Cap 5'

Se añade un nucleótido de 7-metilguanosina al extremo 5'. Protege el ARNm de degradación y facilita el reconocimiento por el ribosoma.

📎 Cola Poli-A

Se añaden ~200 adeninas al extremo 3'. Aumenta la estabilidad del ARNm y facilita su exportación al citoplasma.

✂️ Splicing

El espliceosoma elimina los intrones y une los exones. Permite el splicing alternativo, generando múltiples proteínas de un mismo gen.

Traducción — Síntesis de Proteínas

La traducción ocurre en el citoplasma (o en el RER). El ARNm maduro es leído por el ribosoma, que ensambla aminoácidos transportados por el ARNt para formar una cadena polipeptídica.

1️⃣ Iniciación
2️⃣ Elongación
3️⃣ Terminación
🏃 Velocidad:
Estado: Listo para iniciar — El ARNm maduro se une a la subunidad pequeña del ribosoma
ARNm
Ribosoma (subunidades)
ARNt
Cadena polipeptídica
Aminoácidos

🏁 Iniciación

La subunidad pequeña (40S) se une al ARNm en el cap 5' y escanea hasta encontrar el codón de inicio AUG. El ARNt iniciador (con Metionina) se une al sitio P. Luego se une la subunidad grande (60S).

🔄 Elongación

El ARNt con el aminoácido correcto entra al sitio A. Se forma el enlace peptídico entre el aminoácido del sitio P y el del sitio A. El ribosoma se desplaza (translocación) y el ARNt vacío sale por el sitio E.

🛑 Terminación

Cuando el ribosoma encuentra un codón de parada (UAA, UAG, UGA), un factor de liberación entra al sitio A. La cadena polipeptídica se libera y el ribosoma se desensambla.

Ribosoma y ARN de Transferencia

Conoce en detalle la estructura del ribosoma (ARNr) y del ARNt, sus subunidades, sitios funcionales y cómo interactúan durante la síntesis proteica.

🔬 Estructura del Ribosoma

El ribosoma está compuesto por dos subunidades:

  • Subunidad pequeña (40S en eucariotas / 30S en procariotas): Se une al ARNm y lee los codones
  • Subunidad grande (60S en eucariotas / 50S en procariotas): Contiene la actividad peptidil transferasa (ARNr 28S/23S) que forma enlaces peptídicos
  • Ribosoma completo: 80S (eucariotas) / 70S (procariotas)

📍 Sitios del Ribosoma

  • Sitio A (Aminoacil): Entra el ARNt cargado con un nuevo aminoácido
  • Sitio P (Peptidil): Contiene el ARNt con la cadena polipeptídica en crecimiento
  • Sitio E (Exit): Sale el ARNt descargado (sin aminoácido)

🧬 Estructura del ARNt

El ARNt tiene forma de trébol (2D) o L (3D):

  • Brazo aceptor (extremo 3'): Terminal CCA donde se une el aminoácido específico
  • Anticodón: Triplete de bases complementario al codón del ARNm
  • Brazo TΨC: Interactúa con el ribosoma
  • Brazo D: Reconocido por la aminoacil-ARNt sintetasa
  • Bucle variable: Región de tamaño variable

🤝 Interacción ARNm-ARNt-ARNr

  • ARNm: Proporciona la secuencia de codones (plantilla)
  • ARNt: Traduce codones a aminoácidos mediante su anticodón
  • ARNr: Forma la estructura del ribosoma y cataliza la formación del enlace peptídico (ribozima)
  • Aminoacil-ARNt sintetasa: Enzima que carga cada ARNt con su aminoácido correcto (especificidad)

Código Genético

El código genético es universal (con pocas excepciones), degenerado (múltiples codones para un aminoácido) y no superpuesto. Explóralo en formato circular y de tabla.

Rueda del código genético: Lee desde el centro hacia afuera. 1ª base → 2ª base → 3ª base → Aminoácido

📌 Características del Código Genético

Formación del Enlace Peptídico

El enlace peptídico es un enlace covalente que une dos aminoácidos. Se forma por una reacción de condensación entre el grupo carboxilo (-COOH) de un aminoácido y el grupo amino (-NH₂) del siguiente, liberando una molécula de agua.

⚗️ Reacción Química

H₂N-CH(R₁)-COOH + H₂N-CH(R₂)-COOHH₂N-CH(R₁)-CO-NH-CH(R₂)-COOH + H₂O

1️⃣ Aproximación

Los dos aminoácidos se acercan en el sitio P y A del ribosoma. El grupo carboxilo del aminoacil-ARNt en el sitio P y el grupo amino del aminoacil-ARNt en el sitio A se alinean.

2️⃣ Ataque nucleofílico

El grupo amino (-NH₂) del aminoácido en el sitio A ataca al carbono del grupo carboxilo (-COOH) del aminoácido en el sitio P. La peptidil transferasa (ARNr 28S) cataliza esta reacción.

3️⃣ Liberación de H₂O

Se libera una molécula de agua y se forma el enlace peptídico (-CO-NH-). La cadena polipeptídica queda transferida al ARNt del sitio A.

🔗 Niveles de Estructura Proteica

📏
Primaria

Secuencia lineal de aminoácidos unidos por enlaces peptídicos

🌀
Secundaria

Hélice α y lámina β por puentes de hidrógeno

🔮
Terciaria

Plegamiento 3D por interacciones entre cadenas R

🧩
Cuaternaria

Asociación de varias cadenas polipeptídicas

Aminoácidos: Esenciales y No Esenciales

Los 20 aminoácidos proteinogénicos se clasifican en esenciales (el cuerpo no puede sintetizarlos, deben obtenerse de la dieta) y no esenciales (el cuerpo puede producirlos).

🔴 Aminoácidos Esenciales (9)

🟢 Aminoácidos No Esenciales (11)

🍽️ Fuentes Alimenticias de Aminoácidos Esenciales

🏗️ ¿Cómo se forma una proteína completa?

Una proteína funcional se forma cuando:

Estructura de una proteína: secuencia de aminoácidos plegada en su forma funcional